City
  Population
 
   Tokio
 8.336.599 
   Tokyo (Capital)
 8.336.599 
   Yokohama
 3.574.443 
   Yokohama City
 3.574.443 
   Ōsaka
 2.592.413 
   Nagoya
 2.191.279 
   Sapporo
 1.883.027 
   Kobe City
 1.528.478 
   Fukuoka
 1.392.289 
   Kawasaki
 1.306.785 
   Saitama
 1.193.350 
   Hiroshima
 1.143.841 
   Sendai
 1.063.103 
   Kitakyushu
 997.536 
   Chiba
 919.729 
   Shizuoka
 701.561 
   Kumamoto
 680.423 
   Sagamihara
 648.801 
   Okayama
 639.652 
   Hamamatsu
 605.098 
   Kagoshima
 555.352 
   Niigata City
 505.272 
   Kanazawa
 458.937 
   Utsunomiya
 449.865 
   Ōita
 448.907 
   Matsuyama
 443.322 
   Gifu
 397.714 
   Nara
 367.353 
   Toyota
 362.383 
   Nagano
 360.176 
   Takatsuki
 354.468 
   Suita-shi
 351.630 
   Kashiwa
 340.221 
   Takamatsu
 334.223 
   Toyama
 325.532 
   Miyazaki
 311.203 
   Naha
 300.795 
   Fukushima
 294.237 
   Ichihara
 283.531 
   Maebashi
 282.711 
   Ibaraki
 273.992 
   Tokushima
 267.345 
   Hiratsuka
 259.052 
   Mito
 246.538 
   Takasaki
 240.857 
   Chōfu
 212.977 
   Matsumoto
 210.667 
   Uji
 192.925 
   Suzuka
 191.477 
   Kofu
 190.000